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時值日本大正時期。傳說太陽下山後，有惡鬼出沒吃人，亦有獵鬼人斬殺惡鬼、保護人們。
賣炭少年灶門炭治郎，他那平凡而幸福的日常生活，在家人遭到惡鬼襲擊的那一天發生了劇變。母親與四個弟妹慘遭殺害，而與他一起生還的妹妹禰豆子亦異變成凶暴的鬼。
為了為家人報仇雪恨，也為了讓變成鬼的妹妹重新恢複成人類，灶門炭治郎在獵鬼人的指引下，與尚存理性的妹妹踏上了旅途。
經過兩年艱苦的劍技磨練與賭命試煉，灶門炭治郎與妹妹禰豆子，成為了獵鬼人組織的“鬼殺隊”中的一員。
………………
鬼殺隊，是擁有數百名隊員，未被政府認可卻已經存在了許久的古老組織，自古被稱為“獵鬼人”，已經存在了千年之久。
起初“鬼殺隊”是以討伐存活千年以上的鬼之始祖——鬼舞辻無慘為最終目的而成立的組織，千年以來一直在不斷討伐著無慘及其手下的諸鬼，守護著人們的生命安全。
大約400餘年前的戰國時期，在以繼國兄弟為首的一批使用起始呼吸·日之呼吸的劍士的活躍下，鬼殺隊成功將鬼舞辻無慘逼入了絕境。但由於繼國嚴勝中途背叛了鬼殺隊而投靠了無慘，化身為了劍之鬼——“黑死牟”，導致其弟弟繼國緣一不得不令無慘逃脫，而鬼殺隊針對無慘的圍剿計劃也功虧一簣。
雖然令無慘逃脫，但是繼國緣一帶來的呼吸法使得鬼殺隊擁有了一項對付鬼的利器。雖然無法使用日之呼吸，但鬼殺隊的其他柱還是以日之呼吸的原理為基礎，創造了「水」、「雷」、「炎」、「岩」、「風」五大基礎呼吸法。
在此之後，鬼殺隊的成員們又根據這五大基礎呼吸法創造了「花」、「蛇」、「霞」、「戀」、「音」等多種多樣的派生呼吸法。呼吸法的出現使得鬼殺隊的實力大增，並在與鬼的戰爭中逐漸取得了優勢。
在1868年的明治維新之後，因為武士階級被政府取締，武士刀被禁止，且由於組織並未被政府承認，所以鬼殺隊隊員不能再在大庭廣眾之下攜帶日輪刀行動，隻能在暗中完成滅鬼的任務。
鬼殺隊曾多次遇到瀕臨覆滅的危機，因此400多年前流傳下來的許多信息（如斑紋）因此中斷。
組織構成為幹部與一般隊員。
幹部，鬼殺隊高層由產屋敷家族的當主一人，和最高階的“柱”級幹部隊士九人組成。柱合會議是由當主主持的，由全體柱成員一同參加的決策會議，一般重大的事情都會在這個會議上宣布。
一般隊員，分為甲、乙、丙、丁、戊、己、庚、辛、壬、癸十個階級。新隊員在接受分散各地的培育師訓練後，通過“最終選拔”——在囚禁著鬼的藤襲山待上7日並生還，即可入隊。每名隊員都會配發隊服和日輪刀，並通過會說話的“鎹鴉”進行聯絡以及傳達討伐鬼的任務。
大正時期的鬼殺隊，也就是灶門炭治郎成為鬼殺隊的一屆劍士，鬼殺隊擁有著除最早一批武士外最強的九位柱級劍士。
水柱——富岡義勇
蟲柱——蝴蝶忍
炎柱——煉獄杏壽郎
音柱——宇髄天元
戀柱——甘露寺蜜璃
霞柱——時透無一郎
蛇柱——伊黑小芭內
岩柱——悲鳴嶼行冥
風柱——不死川實彌
再加上實力足以匹敵“柱”級的灶門炭治郎、我妻善逸、嘴平伊之助、栗花落香奈乎等人，這一屆的“鬼殺隊”是即四百年前最初武士之後，最強的“鬼殺隊”。
而鬼舞辻無慘同樣不想被動的任人宰割。在千年時間，靠給人注入他的血液，鬼舞辻無慘孕育而出眾多大小鬼，其中以上弦六鬼與下弦六鬼合稱的“十二鬼月”實力最為強大。
尤其是上弦六鬼，每一隻鬼都足以匹敵三名“柱”級鬼殺隊員的強悍實力。
另外，針對“鬼殺隊”獨有的呼吸法與日輪刀，鬼同樣是有著與之相對的血鬼術，已經近乎不死的身軀和極強的自愈能力，除非被日輪刀斬下頭顱或被日光照射，否則鬼都不會死去。
為了徹底討伐鬼舞辻無慘，鬼殺隊精銳盡出，他們舍生忘死，浴血奮戰，勢要在他們的時代終結這場千年的人鬼大戰。
然而即使是這一期的“鬼殺隊”，在針對鬼舞辻無慘的討伐中最終仍然損失慘重……
鬼殺隊一般隊員死傷過半，灶門炭治郎斬殺下弦之伍·累。
無線列車一戰：炎柱斬殺下弦之壹，隨後在與上弦之叁的交戰中重傷隕落，未能將其斬殺。
花街之戰：合音柱、灶門炭治郎、我妻善逸、嘴平伊之助四人之力，斬殺上弦之陸·妓夫太郎、墮姬兄妹。音柱傷殘引退，灶門炭治郎三人重傷。
無限城之戰：合岩柱、風柱、霞柱、不死川玄彌之力，斬殺上弦之壹·黑死牟。霞柱、不死川玄彌兩人隕落，岩柱、風柱重傷。
無限城之戰：合蟲柱、栗花落香奈乎、嘴平伊之助之力，斬殺上弦之貳·童磨。蟲柱隕落，香奈乎、伊之助重傷。
無限城之戰：合水柱、灶門炭治郎之力斬殺上弦之叁·猗窩座。水柱、灶門炭治郎重傷。
無限城之戰：我妻善逸斬殺新任上弦之陸·獪嶽，我妻善逸重傷。
……………………
經過一係列的血戰，鬼殺隊最終徹底殲滅“十二鬼月”，將起始之鬼·鬼舞辻無慘逼入絕境。
最終決戰，在付出岩柱、風柱、蛇柱隕落的代價，鬼殺隊終於斬殺鬼舞辻無慘，徹底結束了惡鬼作亂的時代。
至此，鬼殺隊九柱僅餘水柱、音柱、戀柱三人，其餘六柱已全部陣亡。
決戰之後，灶門炭治郎之妹灶門禰豆子在藥物的作用下成功恢複為人類，結局理所當然的向著美好發展。
然而，就在鬼殺隊沉浸在終結惡鬼的喜悅中時，異變卻突然出現！
毫無征兆出現的邪惡氣息將鬼滅世界籠罩，在邪氣的影響下，本已被鬼殺隊殲滅的鬼舞辻無慘與其部下“十二鬼月”及眾多惡鬼竟然再度複活！並且他們的力量比巔峰時期更為強盛！
在重生的鬼舞辻無慘與“十二鬼月”麵前，已經失去六柱的鬼殺隊根本無力對抗，血戰之後，鬼殺隊幾近全軍覆沒，不足百餘劍士突出包圍。
在交戰中，音柱、戀柱相繼隕落，水柱被斷一臂，掩護灶門炭治郎、灶門禰豆子、我妻善逸、嘴平伊之助三人狼狽逃離。
惡鬼再次降臨在了世界！！