終章
進入龍脈的核心結界以後，水木當著眾人的麵恢複原身，然後跳進龍脈能量柱裏，獲得了更加強大的力量。
波風水門連同眾人連忙關閉龍脈，穿越到砂隱40年的人全都回到了各自的時代。
水木回到木葉60年，和大蛇丸接觸，參與到木葉毀滅計劃，和大蛇丸聯手殺死了三代目火影猿飛日斬。
大蛇丸也因此沒有被屍鬼封盡傷到。
混亂之中，入侵木葉的人紛紛離開了。
水木的愛人椿無法接受這個事實，離開了木葉，去追捕水木。
而水木的學生奈良餘人則找到了邁特凱，經過一番乞求，成為了邁特凱的弟子，開始學習禁術八門遁甲。
在所有人都把目光注視到水木身上的時候，大蛇丸照常把宇智波佐助捉來培訓成一個強大的容器，劇情照常發展。
而水木為了彌補精神力量方麵的弱點，用草雉劍，從大蛇丸手上，交易到了靈化之術，通過不斷鑽研，終於研究出強化靈魂的手段。
他躲在音隱村修煉，結果還是被椿找到了。
但是那個時候，水木正在修煉靈魂，進入了沉睡的狀態，對椿的到來毫不知情。
椿進入音隱村以後，和藥師兜大戰一場，也被藥師兜誘導出了她的身份，知曉椿的身份以後，藥師兜出於惡趣味，把椿引入大蛇丸的密室。
椿義正辭嚴和大蛇丸對峙了一番。
大蛇丸並不知道椿是誰，但他手下修煉出龍地洞仙人模式的宇智波佐助知道，大蛇丸讓宇智波佐助和椿交手，於是宇智波佐助把椿打敗。
但是椿並不死心，滿身傷痕地問大蛇丸關於水木的消息，大蛇丸沒有回答，宇智波佐助則冷著眼說了一聲聒噪，用大蛇丸給他的草雉劍，一劍捅穿了椿的心髒。
水木心有所感，立刻出來，結果看見了椿的死狀。
水木猛然發狂，把宇智波佐助打得落荒而逃，大蛇丸顯出八岐大蛇真身來阻止水木，結果水木耗盡全身力量將大蛇丸擊敗，大蛇丸昏迷不醒。
水木毀滅了音隱村，為椿埋葬。
然後，水木把大蛇丸的皮囊剝光，讓大蛇丸的女兒身暴露無遺。
大蛇丸醒過來，質問水木意欲何為。
而水木則封印住大蛇丸的力量，打斷了大蛇丸的手腳，然後在狂笑中，把光溜溜的女性身體的大蛇丸丟進了一家土匪窩裏。
兩年時限到了，曉組織的人來召喚水木。
水木便和佩恩一起，捉了九大尾獸，惹怒了整個忍界。
和原著一樣，在鐵之國的推動下，五大忍者村聯合起來，向曉組織宣戰。
等到漩渦長門耗盡生命力死去以後，宇智波帶土隨後幹死了小南，控製了曉組織。
水木一直冷眼旁觀，沒有阻止帶土的行動。
之後，第四次忍界大戰爆發。
帶土如願以償地成為複活十尾，這時候，水木突然冒出來，搶先吸收了十尾。
十尾人柱力狀態下的水木和穢土重生的宇智波斑、各代火影作戰。
這時候，黑絕上場，想要控製水木，結果被修煉了靈魂力量的水木吊起來打。
水木當眾把黑絕謀劃了千年的計劃說了出來，所有人為之駭然。
之後六道仙人突然出現，奪回了十尾，黑絕見縫插針，控製了十尾，召喚出了大筒木輝夜。
一直等待這一刻的黑袍人跑出來，顯出真身，原來黑袍人就是千年前祖之國的國王天子，也就是大筒木輝夜的丈夫，六道仙人他爸爸。
黑袍人滿懷深情地對大筒木輝夜致歉，說當年不該為了和平就把輝夜獻貢給其他國家，導致了如今的悲劇，勸輝夜停手。
然後六道仙人又出現，把黑袍人拉進了輪回。
水木跟著進去，發現所謂輪回，其實是六道仙人建造的一個小世界，這個小世界可以吸收亡靈，然後把亡靈的力量為己所用，延續生命。
黑袍人和六道仙人大戰一場，結果被六道仙人用一口大鍋鎮壓。
黑袍人告訴水木，那口大鍋就是整個輪回的核心，是六道仙人的仙器，六道仙人平常捉輪回中的百億亡靈，用這口大鍋來油炸鬼魂，再吞食鬼魂，用以維持自己的靈體長存。
黑袍人把自己全部力量傳給水木，請他打破大鍋。
水木又得到了一股無可匹敵的力量，但是，卻沒有按照黑袍人所說的，打破六道仙人的仙器。
“事情恐怕沒有那麽簡單吧。”水木說著這樣的話。
探尋出這一切事件背後的真相。
之後，他回到戰場之中，殺死了大筒木輝夜，接著將一個個強者打敗。
所有強者把剩餘的力量全部灌輸到宇智波佐助和漩渦鳴人的身上。
宇智波佐助和漩渦鳴人以強悍無比的氣勢挑戰水木。
水木將二人打敗，緊接著，一手一個大波，把五大國一一毀滅。
在所有人心生絕望的時候，奈良餘人站了出來。
他爆發了八門遁甲衝到水木跟前，卻被水木一把捉住。
奈良餘人看著分崩離析的陸地，哀嚎不斷的人民，淚流滿麵的質問水木，為什麽要那麽心狠手辣毀滅世界。
水木笑了笑。
提著奈良餘人的衣服，直衝天際。
水木帶著奈良餘人，飛出了天空，來到了外太空。
“看看這個宇宙。”水木的聲音在奈良餘人的心頭響起。
奈良餘人看著星光燦爛的宇宙，不知所措。
而水木則帶著餘人直飛到太陽的跟前。
無邊無際的太陽散發著可怖的高溫。
水木一拳砸向太陽。
巨大無比的太陽居然裂開了一個破洞。
奈良餘人無比震驚地看著那個破洞。
而水木則冷靜說：“那是一個虛假的太陽。”
言語間，水木又朝著廣袤無垠的宇宙胡亂出拳。
一個個詭異的破洞出現在太空中。
奈良餘人看著那些破洞，發現每一個洞口裏都浮現出一個個似曾相識的畫麵。
水木告訴他說：“你看，這個世界以外，還有無數個相似的世界，那些世界，生活著無數個宇智波佐助、無數個漩渦鳴人、無數個六道仙人、無數個你。”
奈良餘人驚慌失措。
水木指著那個太陽，繼續說：“這是一個紙糊的世界，紙的背後，全是虛無。”
“每個人都活在這個虛假的世界，按照規定好的劇情相愛相殺、生老病死，然後等到某一個時刻，紙張就會被撕碎，接上另一張新的白紙，而曾經的愛恨情仇也將在新的白紙上再次重複，唯一的變化就是每一個翻篇，都會有一個奇怪的人加入。”
水木指著那些破洞——
“你看那個世界，有一個叫葉梓的家夥正在吃著人肉……”
“還有那個世界，有一個叫朝佚千名的人已經站到了忍界的巔峰……”
“再看那個世界，有一個名叫漩渦正彥，活了幾百年的老不正經，正在木葉村當著老祖宗……”
水木回頭衝奈良餘人笑著：“還有那個世界，也有一個水木，自稱水母仙人，活得很是滋潤。”
奈良餘人看著這些畫麵，不知道說些什麽好。
“我也是虛假的嗎？”奈良餘人問。
“啊……所有的一切，都是假的。”水木說，“這個世界的六道仙人，察覺到了這個世界的虛假，通過種種手段，企圖連接到其他世界，結果導致了種種變數。”
“你也是嗎？”奈良餘人問。
“不——”水木說，“我不是六道仙人導致的變數，我也不知道自己怎麽來的。”
說話間，外太空中的破洞漸漸回攏。
奈良餘人問：“這個世界要崩潰了嗎？”
水木搖頭說：“這個世界即將重啟，所有人，都會回到木葉60年春。”
“那麽你呢？”
“放心吧，也會有一個新的水木出現，做和我不一樣的事情……”
水木把奈良餘人推下去。
“聽著餘人，重啟後的世界，你將是最偉大的英雄。”
“為什麽？”
“因為到時候我會送給你一個禮物。”
“你要去哪？”
“我？我會去紙後的世界看看。”
水木說著，飛進了其中一個破洞裏。