大結局

  林夕機緣巧合下得到外來宇宙受損的旗艦神州號，並與神州號智腦藍靈結識，在藍靈的幫助下林夕一邊修復神州號一邊發展科技，建立公司，創造了巨大利益，幫助國家發展國防科技。期間與地球遠古文明亞特蘭蒂斯產生多次衝突，最終阻止其奴役人類稱霸地球的目的。而後促使地球統一為地球聯邦帶領人類文明進軍銀河系，發現了被野蠻的哈雷帝國奴役的宇宙人類的存在，為了解救同胞和探尋宇宙人類的起源，林夕同地球聯軍通過與哈雷帝國和銀河系紅葉聯邦的戰爭確立了人類對銀河系的霸權，逐步與銀河系其他種族成立了銀河聯盟。通過神州號內基因科技，人類的壽命不斷的提高。


  在科技進步及和平帶來的安逸和舒適的時候，一個傷痕纍纍的星際艦隊逐步向銀河系靠攏，通過這個艦隊帶來的信息，林夕及銀河聯盟獲悉了宇宙大半被一個神秘勢力攻佔，大量種族慘遭屠殺，戰爭在全宇宙爆發。為了保衛銀河系的和平，林夕著手創立遠征軍，準備與宇宙聯盟一同反抗。在林夕還沒來得及出發會盟宇宙各族聯軍時，宇宙中早已經銷聲匿跡的蟲族再現，林夕不得不先去抵抗蟲族。與蟲族交戰期間林夕得知了神秘勢力是由一個叫淵釋天的人所控制。後來林夕與淵釋天的艦隊交戰，第一次戰鬥就遭到了慘敗，致使遠征軍團的先遣艦隊全軍覆沒，林夕也差點命喪戰場，這也讓林夕全方位的重視對手。之後林夕同淵釋天進行多次戰鬥，雙方的戰艦實力相同，沒多久雙方對峙起來，誰也沒辦法快速結束戰爭。通過林夕的戰功，宇宙聯盟逐步開始以林夕為首，推舉林夕為宇宙聯盟最高主席。


  最後神州號完全修復，林夕從神州號修復的文件中得知淵釋天是原來神州宇宙時神州號的前任艦長，在神州文明打開宇宙通道時在巧合下來到林夕所在的宇宙，並且得知神州宇宙並沒有像藍靈所說的完全毀滅，而只是打開宇宙通道時造成神州宇宙受到重創。林夕得知情況后本想勸說他放棄自己的野心，沒想到淵釋天卻趁著和林夕談判時偷襲宇宙聯盟後方，使宇宙聯盟損失慘重，使林夕領導的宇宙聯盟喪失戰爭的主動權。


  在淵釋天的步步緊逼之下，林夕也看清楚了淵釋天的面目，同藍靈以神州號為旗艦被迫與其進行決戰，期間人類結合神州文明的科技製造出神級武器在宇宙聯盟即將失敗的最後時刻力挽狂瀾，一舉打敗淵釋天，並從將死的淵釋天口中得知人類的起源和淵釋天統一宇宙的目的——為了獲得全宇宙的能量打開宇宙通道回到神州宇宙。林夕同情淵釋天對故鄉的熱愛，但依然無法原諒淵釋天屠殺無辜種族和釋放蟲族的行為。因為戰爭的緣故人口大量減少的宇宙各種族，再也無法對人口已經遍及全宇宙的人類產生威脅，宇宙各族也通過這場戰爭知道了和平的重要性，宇宙走向了聯合。